@conference {acfas2012,
	title = {mycoMINE : un syst{\`e}me de fouille de texte s{\'e}mantique d{\'e}di{\'e} {\`a} la recherche de biocarburants de seconde g{\'e}n{\'e}ration},
	booktitle = {80{\`e}me Congr{\`e}s de l{\textquoteright}ACFAS},
	year = {2012},
	month = {05/2012},
	type = {Poster},
	address = {Montr{\'e}al, QC, Canada},
	abstract = {Dans la course pour remplacer les combustibles fossiles par des biocarburants renouvelables, la d{\'e}couverte d{\textquoteright}enzymes d{\'e}gradant efficacement la lignocellulose est un d{\'e}fi majeur. Pour identifier ces enzymes, les biologistes rassemblent les r{\'e}sultats exp{\'e}rimentaux publi{\'e}s dans une litt{\'e}rature scientifique dont volume et diversit{\'e} des sources sont en expansion constante. Analyser la litt{\'e}rature n{\'e}cessite une lecture appronfondie de toutes les publications pertinentes mais cette t{\^a}che est difficilement exhaustive et des informations cruciales peuvent {\'e}chapper au lecteur.

Combinant outils de fouille de texte s{\'e}mantique et ressources ontologiques, notre syst{\`e}me mycoMINE extrait automatiquement de la litt{\'e}rature les connaissances concernant les enzymes fongiques. mycoMINE est int{\'e}gr{\'e} dans les outils des utilisateurs (navigateurs, {\'e}diteurs de textes, wikis) via la plateforme Semantic Assistants. Les performances de mycoMINE sont {\'e}valu{\'e}es sur un corpus, librement accessible, d{\textquoteright}articles scientifiques manuellement annot{\'e}s par des biologistes experts. Les {\'e}valuations men{\'e}es sur les quatres entit{\'e}s les plus fr{\'e}quentes - organisme, enzyme, pH et temp{\'e}rature - extraites automatiquement montrent que plus de 90\% des entit{\'e}s pr{\'e}sentes sont trouv{\'e}es par mycoMINE.

mycoMINE, d{\'e}velopp{\'e} pour le projet Genozymes, est le premier syst{\`e}me de fouille de texte s{\'e}mantique d{\'e}di{\'e} {\`a} la recherche d{\textquoteright}enzymes fongiques impliqu{\'e}es dans le d{\'e}veloppement des biocarburants de deuxieme g{\'e}n{\'e}ration.},
	attachments = {https://www.semanticsoftware.info/system/files/acfas2012_poster.jpg},
	author = {Marie-Jean Meurs and Bahar Sateli and Caitlin Murphy and Ren{\'e} Witte and Greg Butler and Justin Powlowski and Adrian Tsang}
}
